2X 探针法qPCR Mix (TaqMan荧光定量PCR试剂盒)是基于荧光探针检测的即用型 PCR 试剂盒,可以对靶片段进行实时定量 PCR 分析(quantitative PCR、qPCR)。
产品含有经过优化的缓冲液组分、热启动 Taq DNA 聚合酶、Taq DNA 稳定剂、dNTPs、MgCl2和稳定剂等所有实时定量 PCR 所需要的成分
荧光定量PCR(qPCR)是大家常用的分子生物学技术,根据实验方法的不同
qPCR可以分为染料法(SYBR Green法为代表)和探针法(Taqman法为代表)
因为操作简单,价格便宜,SYBR Green法qPCR 受到了更为普遍的使用。
但是SYBR Green法并非万能的,在很多时候SYBR Green无法满足实验的需要
Taqman qPCR特异性强,信噪比高,能够适用于多重qPCR,数据更具说服力
Taqman法qPCR的原理:
Taqman是一段短的单链DNA探针,能够和模板DNA进行退火。Taqman探针的5’端带有一个报告基团(R),3’端带有一个猝灭基团(Q)。报告基团所发出的荧光会被猝灭基团所吸收,因此正常情况下荧光探针是不会发出荧光的。在PCR的延伸过程中,DNA聚合酶沿着模板链从5’到3’的方向合成新链,当DNA聚合酶到达Taqman探针结合位点时,DNA聚合酶的5’-3’外切酶活性会将Taqman探针进行水解,导致Taqman探针的报告基团脱离了猝灭基团,从而发出荧光。可以根据荧光值的高低,判断PCR过程中目的片段产生的多少,从而实现对目的基因进行实时定量。
在Taqman qPCR中,上下游引物只有扩增探针所结合的片段时,才会产生荧光,非特异扩增是不会产生荧光的,因此Taqman qPCR的特异性非常好。另外,可以用不同的报告基团,标记多个荧光探针,实现在一管PCR体系中,同时对多个基因进行定量,这样不仅实验的通量大大提高,而且实验的一致性也更好。
什么时候需要使用探针法qPCR:
相对于SYBR Green qPCR,探针法qPCR需要设计和合成特异的荧光探针,增加了设计难度和实验成本。但是,当你遇到如下情况时,Taqman qPCR是你的第一选择。
>>>1.基因检测
以Taqman为代表的探针法qPCR最常用的应用场景就是基因检测,包括医疗诊断,环境微生物检测,转基因检测等。这些应用场景对结果的特异性要求非常高,而染料法qPCR的结果很容易受到非特异性扩增的干扰,因此一般都是使用Taqman qPCR进行检测。
>>>>2.很难设计特异性引物
qPCR对引物的扩增效率要求很高,如果用相对定量法(Livak法)进行数据分析,需要保证引物的扩增效率在90%到105%之间,否则最后得到的数据不真实。然而有时候,为了保证扩增的特异性,只能在某个特异位点设计引物,从而牺牲了一些其它的引物设计原则,比如GC含量过高,引物有二级结构等,导致qPCR扩增的效率过低。这种情况下用Taqman qPCR可以很好的解决这一点,因为Taqman 探针本身就可以保证特异性,因此设计引物的时候有更多灵活性,更容易设计扩增效率高的引物对。
>>>>3.发表高水平文章
由于Taqman法比SYBR Green法具有更好的特异性,实验结果更接近真实,所以很多高水平文章更青睐于Taqman qPCR的结果。特别是一些关键基因的关键结果,如果有Taqman qPCR的数据,会给你的文章加分不少。