溴酚蓝（Bromophenol blue），生物学中常用的一种示踪染料、酸碱指示剂。作为示踪染料，本品可作为一种颜色标记用于核酸（琼脂糖）、蛋白质（聚丙烯酰胺）凝胶电泳；
作为一种pH指示剂，其有效指示范围在3.0-4.6，其颜色变化从黄色（pH3.0）到蓝紫色（pH4.6）。
作为指示剂，因为溴酚蓝呈蓝色，而蛋白质是白色，在SDS-凝胶中不明显，且溴酚蓝的相对分子量比蛋白质(绝大部分)小，
电泳时速度比蛋白质稍快，因此当溴酚蓝到达电泳槽底部(可看蓝色调带)，则电泳结束。
配置方法:
方法1：1%的溴酚蓝
将托盘天平上称取1g溴酚蓝定溶于100ml无水乙醇中，转移入滴瓶中，贴标签备用。
方法2：0.05%的溴酚蓝
配western blot用的2*SDS上样缓冲液需要用到0.1%的溴酚蓝，2-DE中溴酚蓝一般也是配成0.1%母液。实际上，溴酚蓝在水中的溶解度不高，直接将0.1g溴酚蓝溶于100ml水是有困难的。下面是其较合适的配制方法：
0.05%的溴酚蓝配制方法：取溴酚蓝0.1g，加0.05mol/L氢氧化钠溶液3.0ml使溶解，再加水稀释至200ml，即得。 变色范围pH2.8～4.6（黄→蓝绿）。只是不知道加入NaOH会不会影响2-DE实验。估计影响不大，因为指示剂用量毕竟很少。
方法3：1%溴酚蓝
加1g水溶性钠型溴酚蓝于100ml水中，搅拌或涡旋混合直到完全溶解。溴酚蓝其钠盐易溶解在水里。
