1.翻译后修饰-比如蛋白的磷酸化，糖基化等，这些都会增加蛋白的分子量大小。

2.翻译后剪切-比如很多蛋白首先被合成为前体形式，然后通过剪切获得生物学活性。

3.剪切变异体-相同的基因，经过选择性剪接会产生不同分子量大小的蛋白。

4.相对电荷-氨基酸的组成（带电vs不带电）。

5.多聚体-比如蛋白二聚体